WormBase Tree Display for Variation: WBVar00143398
expand all nodes | collapse all nodes | view schema
| WBVar00143398 | Evidence | Paper_evidence | WBPaper00005927 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | Public_name | e678 | |||||||
| Sequence_details | Type_of_mutation | Deletion | |||||||
| SeqStatus | Pending_curation | ||||||||
| Variation_type | Allele | ||||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis elegans | |||||||
| Strain (225) | |||||||||
| Laboratory | CB | ||||||||
| LW | |||||||||
| Status | Live | ||||||||
| Affects | Gene | WBGene00003056 | |||||||
| Interactor | WBInteraction000521785 | ||||||||
| WBInteraction000521941 | |||||||||
| WBInteraction000524031 | |||||||||
| WBInteraction000537302 | |||||||||
| Genetics | Mapping_data | In_2_point | 154 | ||||||
| 159 | |||||||||
| 162 | |||||||||
| 164 | |||||||||
| 165 | |||||||||
| 166 | |||||||||
| 167 | |||||||||
| 168 | |||||||||
| 169 | |||||||||
| 170 | |||||||||
| 171 | |||||||||
| 172 | |||||||||
| 173 | |||||||||
| 174 | |||||||||
| 175 | |||||||||
| 176 | |||||||||
| 283 | |||||||||
| 286 | |||||||||
| 288 | |||||||||
| 299 | |||||||||
| 374 | |||||||||
| 397 | |||||||||
| 414 | |||||||||
| 427 | |||||||||
| 428 | |||||||||
| 434 | |||||||||
| 475 | |||||||||
| 624 | |||||||||
| 1829 | |||||||||
| 3148 | |||||||||
| 3150 | |||||||||
| 3384 | |||||||||
| 3634 | |||||||||
| 3731 | |||||||||
| 4456 | |||||||||
| 4467 | |||||||||
| 4570 | |||||||||
| 6103 | |||||||||
| 6110 | |||||||||
| 6111 | |||||||||
| 6119 | |||||||||
| 6122 | |||||||||
| 6135 | |||||||||
| 6172 | |||||||||
| 6173 | |||||||||
| 6187 | |||||||||
| In_multi_point (108) | |||||||||
| In_pos_neg_data (19) | |||||||||
| Marked_rearrangement | szT1[lon-2(e678) unc-29(e403)] | ||||||||
| szT1[lon-2(e678)] | |||||||||
| Description | Phenotype (24) | ||||||||
| Phenotype_not_observed | WBPhenotype:0000505 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Males are not Ram. | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| EQ_annotations | Anatomy_term | WBbt:0006941 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Life_stage | WBls:0000056 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Temperature | 20C | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Genotype | him-5(e1490) | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0001652 | Paper_evidence | WBPaper00032446 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
| WBPhenotype:0001767 | Paper_evidence | WBPaper00032413 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
| Remark | No significant defects in embryonic DA/DB motor neuron left/right projection patterns (Figure S1A). | Paper_evidence | WBPaper00032413 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
| Variation_effect | Null | Paper_evidence | WBPaper00032413 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson2021 | ||||||||
| Reference (33) | |||||||||
| Remark | e678 is a ~9 kb deletion | ||||||||
| Variation stub/paper connection generated from the May 2021 NN VFP dataset. | |||||||||
| Created by WBPerson51134 from the NN_VFP_triage_pipeline | |||||||||
| Method | Deletion_allele |
