WormBase Tree Display for Feature: WBsf925321
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| WBsf925321 | SMap | S_parent | Sequence | OVOC_OM1b_209 |
|---|---|---|---|---|
| Sequence_details | Flanking_sequences | ctaagaaataaggatccttgaaattattttgacatttattccatatgttaatttaaaccattgtaacaatatatattgcctaatcttaatcagttaaataatgtgtagcgcagttaataaattaaataaaatgtggtgcaattctttcttcaactcacttaaattctttacactggtctttttatattatttatcatgcacaaatactgatttttttagaattttataaacttataaattcatggttgagaagaaagaaagaaatgaaacacttaagatagaacgaaaggtgatcaaggagtttccttaatgaaaaaagcaaatatacaattttttggtatcataatatattggattttatttcatattttggtttattaggccttgacagattgaattgtatttcattttatgcacccagttagacgaggagttaacttcatactaataatttggccaatattttccctaacctttaggttcatgtttaattaaatacttgagttaaaatttggtgaaaaaaaaaatttagaatggaaaaaaaaaaaatttcttttccagaattgaactctaagaacgtggtgcacttgtaaatgtcggtatatatttcaaaaagatacattttacattgcatgccataaaaaatgtaactgtgtgtaaacccgaaataacttttctgtctaaaaatatttacactacaaaaaattatttgaatcgttatccaattcacatgtaatatccgatatgataatcatgtaagatgtaaagttcttcacattcgatatgctaattattacaaaaagtatatactttcttataccaatctcttatacagcatgagaaagctgtgtaattcccttttttgtattctataagccacacccgcttatcgagaataaaagagattattgaatttggtgaagcacgtggctggtgtcttcgattgcagtaacttcgattattgtaattgaagctagtggctattgtaaactattataatttcgacttgataagcttcgacttggtaatcttcggctattataattttaattctataaacttctacttcttgatattttgttctatatattgctctctaatcaattatttgtgatactaacaataaaaataaaaactaattgtccatgcattcgtcaattcgattcaaatcgtaactcttttttttttactaacgctaattcttcatttcaaagaaggaaaaattcatgacacaatataacaaccaaaataaaaaatgaaagagaaaataaaactatgaaaattaattatttcgaaagttttcaaaattgcataaactctattataatataatggtagtatgttatcaaaatcgggagaaaaaaccaaattcttattttaatcttgacagtagtattaacttccaaatgtttgaactaataaacttggtgaaaattcctttattttgaaaggtttttattggggattggaacttggtacagattgttgagaaattacttgtatgatctcaggaaaagagtcttcttgtttgtttgtagcttattgtttcgagattgatttctcttgcaatttgatttcgctaagtcaacaacagcctttattgagtttatacgatatcagaacacaatatcgcggttatacaatagcaaaggctgattgaacattgtctaaacacagcagttaccaagggataaacatgtttgccgccaaaacatcacccatttattgataagcaagtgaggtcaatcaatcatgaagcgacacgatgtaattcaagtttactacaaaggggaaaatctcacaaagatttaaaaggtcaagattttttag | tgctcaactcagatggacacaattattcaacatagcagcagtcctgagcaattcaattcgatacaattcaacagttcagatgaagcagttcagcaacaacgcaatttcgaggataattgacgcagcaagagtgttcgtctgttcaaaatcttaaacctccgtaagtttttaaacacgcacattatctacattcaaaatcttaaataccggaaagtccttgacttattgctttgaaattttgacacaaagttgcagtcgaatacgcgcatgtttttaaatattcatcaattgatttcaaattttgatacgcgttgcattgcaatgggtaaatgtttttaaataattaaggcgagcaattcaagcttttcgtttgttttttgctttgtgggaaatgtaactcgtttattttttgatttgtgggggatttagttgcgttgcactaatgtcgacgtcaggatagtgtattatcaattgtttcgttcaagcaatttaaagattatctctctgacttctattgttagattttgttttgaattgcctcttttcgtaaattttacccattgatctaaaccgcacaactgtaaggatttctctgagctttgttgagcgtgaac | |
| Mapping_target | OVOC_OM1b_209 | |||
| Origin | Species | Onchocerca volvulus | ||
| Visible | Description | SL1 trans-splice leader acceptor site | ||
| SO_term | SO:0000706 | |||
| Defined_by | Defined_by_analysis | RNASeq.ovolvulus.O_volvulus_Cameroon_isolate.WBls:0000108.Unknown.WBbt:0007833.PRJEB2965.ERX200391 | 1 | |
| Remark | Defined by RNASeq data (example read: ERR225731.8908059.+.SL1 - 92M) from RNASeq.ovolvulus.O_volvulus_Cameroon_isolate.WBls:0000108.Unknown.WBbt:0007833.PRJEB2965.ERX200391 with 1 reads | |||
| Method | SL1 |
