WormBase Tree Display for Gene: WBGene00000701
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WBGene00000701 | Evidence | Person_evidence | WBPerson345 | ||||||
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WBPerson651 | |||||||||
SMap | S_parent | Sequence | F54D1 | ||||||
Identity | Version | 1 | |||||||
Name | CGC_name | col-127 | Person_evidence | WBPerson345 | |||||
Sequence_name | F54D1.3 | ||||||||
Molecular_name | F54D1.3 | ||||||||
F54D1.3.1 | |||||||||
CE05937 | |||||||||
Other_name | CELE_F54D1.3 | Accession_evidence | NDB | BX284604 | |||||
Public_name | col-127 | ||||||||
DB_info | Database | AceView | gene | 4M30 | |||||
WormQTL | gene | WBGene00000701 | |||||||
WormFlux | gene | WBGene00000701 | |||||||
NDB | locus_tag | CELE_F54D1.3 | |||||||
NCBI | gene | 186228 | |||||||
RefSeq | protein | NM_069715.3 | |||||||
TREEFAM | TREEFAM_ID | TF316783 | |||||||
TrEMBL | UniProtAcc | G5EFU8 | |||||||
UniProt_GCRP | UniProtAcc | G5EFU8 | |||||||
Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
History | Version_change | 1 | 07 Apr 2004 11:29:21 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from geneace | ||
Status | Live | ||||||||
Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
Gene_class | col | ||||||||
Allele | WBVar01500079 | ||||||||
WBVar01498996 | |||||||||
WBVar01581774 | |||||||||
WBVar01499925 | |||||||||
WBVar01499585 | |||||||||
WBVar01499586 | |||||||||
WBVar02037168 | |||||||||
WBVar01500245 | |||||||||
RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
GO_annotation | 00107693 | ||||||||
Ortholog (55) | |||||||||
Paralog (39) | |||||||||
Structured_description | Automated_description | Predicted to be a structural constituent of cuticle. | Paper_evidence | WBPaper00065943 | |||||
Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
WBPerson37462 | |||||||||
Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
Molecular_info | Corresponding_CDS | F54D1.3 | |||||||
Corresponding_CDS_history | F54D1.3:wp228 | ||||||||
Corresponding_transcript | F54D1.3.1 | ||||||||
Other_sequence | CB036665.1 | ||||||||
MC00845 | |||||||||
Dviv_isotig10367 | |||||||||
HGC10229_1 | |||||||||
ES411832.1 | |||||||||
HG08072 | |||||||||
MH05228 | |||||||||
JI468768.1 | |||||||||
HGC04409_1 | |||||||||
HG02519 | |||||||||
HG10417 | |||||||||
Dviv_isotig10369 | |||||||||
JI216289.1 | |||||||||
EX544416.1 | |||||||||
EX009554.1 | |||||||||
HG03441 | |||||||||
AM744085.1 | |||||||||
HSC01029_1 | |||||||||
HGC10832_1 | |||||||||
TCC02482_1 | |||||||||
HG10596 | |||||||||
OVC00224_1 | |||||||||
HG07885 | |||||||||
EX548726.1 | |||||||||
HGC09468_1 | |||||||||
TCC02515_1 | |||||||||
HG07447 | |||||||||
CD748199.1 | |||||||||
AI061478.1 | |||||||||
EX541151.1 | |||||||||
HG07650 | |||||||||
JI181072.1 | |||||||||
HG09738 | |||||||||
FM207874.1 | |||||||||
FC811041.1 | |||||||||
FM207706.1 | |||||||||
HS00248 | |||||||||
MHC02614_1 | |||||||||
HGC01490_1 | |||||||||
DN190512.1 | |||||||||
HG11576 | |||||||||
HG11571 | |||||||||
HG07897 | |||||||||
HGC00566_1 | |||||||||
TX00599 | |||||||||
HG07493 | |||||||||
AA618700.1 | |||||||||
MI02628 | |||||||||
HGC00566_5 | |||||||||
EX914862.1 | |||||||||
HG11784 | |||||||||
MA01396 | |||||||||
Tcir_isotig31526 | |||||||||
MCC00701_1 | |||||||||
HG07453 | |||||||||
HG07824 | |||||||||
MIC05903_1 | |||||||||
AI096135.1 | |||||||||
Dviv_isotig01353 | |||||||||
HC09295 | |||||||||
SSC06468_1 | |||||||||
HG04076 | |||||||||
MH06114 | |||||||||
Dviv_isotig10368 | |||||||||
HC02363 | |||||||||
HGC05863_1 | |||||||||
ZPC00142_1 | |||||||||
HGC08452_1 | |||||||||
Dviv_isotig10370 | |||||||||
HG11197 | |||||||||
MC00203 | |||||||||
HG11742 | |||||||||
HGC05082_1 | |||||||||
HG07883 | |||||||||
MCC03833_1 | |||||||||
HG07913 | |||||||||
EX910830.1 | |||||||||
GO251605.1 | |||||||||
HG07446 | |||||||||
Associated_feature | WBsf230851 | ||||||||
Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00048279 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
WBRNAi00015595 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
WBRNAi00048280 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
Expr_pattern | Expr1152082 | ||||||||
Expr2010322 | |||||||||
Expr2028566 | |||||||||
Drives_construct | WBCnstr00037356 | ||||||||
Construct_product | WBCnstr00037356 | ||||||||
Microarray_results | SMD_F54D1.3 | ||||||||
SMD_F54D1.4:2 | |||||||||
172794_x_at | |||||||||
189978_s_at | |||||||||
Aff_F54D1.2 | |||||||||
Expression_cluster (86) | |||||||||
Interaction (90) | |||||||||
Map_info | Map | IV | Position | 4.93428 | |||||
Positive | Positive_clone | F54D1 | Inferred_automatically | From CDS info | |||||
From sequence, transcript, pseudogene data | |||||||||
Pseudo_map_position | |||||||||
Reference | WBPaper00038491 | ||||||||
WBPaper00055090 | |||||||||
WBPaper00059172 | |||||||||
Remark | Map position created from combination of previous interpolated map position (based on known location of sequence) and allele information. Therefore this is not a genetic map position based on recombination frequencies or genetic experiments. This was done on advice of the CGC. | CGC_data_submission | |||||||
Method | Gene |