WormBase Tree Display for Gene: WBGene00020613
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| WBGene00020613 | SMap | S_parent | Sequence | T20D4 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identity | Version | 1 | |||||||
| Name | Sequence_name | T20D4.7 | |||||||
| Molecular_name | T20D4.7 | ||||||||
| T20D4.7.1 | |||||||||
| CE51267 | |||||||||
| Other_name | CELE_T20D4.7 | Accession_evidence | NDB | BX284605 | |||||
| Public_name | T20D4.7 | ||||||||
| DB_info | Database | AceView | gene | 5D883 | |||||
| WormQTL | gene | WBGene00020613 | |||||||
| WormFlux | gene | WBGene00020613 | |||||||
| NDB | locus_tag | CELE_T20D4.7 | |||||||
| Panther | gene | CAEEL|WormBase=WBGene00020613|UniProtKB=P91468 | |||||||
| family | PTHR13871 | ||||||||
| NCBI | gene | 188643 | |||||||
| RefSeq | protein | NM_071553.7 | |||||||
| TREEFAM | TREEFAM_ID | TF331873 | |||||||
| TrEMBL | UniProtAcc | P91468 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | P91468 | |||||||
| Species | Caenorhabditis elegans | ||||||||
| History | Version_change | 1 | 28 May 2004 13:31:03 | WBPerson1971 | Event | Imported | Initial conversion from CDS class of stlace from WS125 | ||
| Status | Live | ||||||||
| Gene_info | Biotype | SO:0001217 | |||||||
| Allele (41) | |||||||||
| RNASeq_FPKM (74) | |||||||||
| GO_annotation | 00105809 | ||||||||
| 00125214 | |||||||||
| 00125215 | |||||||||
| Ortholog (42) | |||||||||
| Paralog (11) | |||||||||
| Structured_description | Automated_description | Involved in PERK-mediated unfolded protein response. Is an ortholog of human NXNL2 (nucleoredoxin like 2). | Paper_evidence | WBPaper00065943 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson324 | ||||||||
| WBPerson37462 | |||||||||
| Inferred_automatically | This description was generated automatically by a script based on data from the WS291 version of WormBase | ||||||||
| Date_last_updated | 29 Nov 2023 00:00:00 | ||||||||
| Molecular_info | Corresponding_CDS | T20D4.7 | |||||||
| Corresponding_CDS_history | T20D4.7:wp252 | ||||||||
| Corresponding_transcript | T20D4.7.1 | ||||||||
| Other_sequence | ACC03776_1 | ||||||||
| JI212773.1 | |||||||||
| FE910485.1 | |||||||||
| EH005413.1 | |||||||||
| AI253474.1 | |||||||||
| HG03067 | |||||||||
| MIC07429_1 | |||||||||
| HG01370 | |||||||||
| MI02223 | |||||||||
| BE720929.1 | |||||||||
| CN477508.1 | |||||||||
| JI217754.1 | |||||||||
| GE625607.1 | |||||||||
| HC09775 | |||||||||
| JI214712.1 | |||||||||
| AS15396 | |||||||||
| AE02218 | |||||||||
| MPC01346_1 | |||||||||
| FE914833.1 | |||||||||
| FC821375.1 | |||||||||
| GO239247.1 | |||||||||
| ASC17353_1 | |||||||||
| JI224014.1 | |||||||||
| LSC00405_1 | |||||||||
| JI219781.1 | |||||||||
| AIC00290_1 | |||||||||
| JI182511.1 | |||||||||
| Tcol_isotig10774 | |||||||||
| MH01434 | |||||||||
| Tcir_isotig08724 | |||||||||
| TDC00247_1 | |||||||||
| Tcol_isotig10775 | |||||||||
| BU666064.1 | |||||||||
| PPC14375_1 | |||||||||
| OVC04051_1 | |||||||||
| AS02824 | |||||||||
| Acan_isotig00012 | |||||||||
| CB043327.1 | |||||||||
| JO471632.1 | |||||||||
| HC01205 | |||||||||
| AA934228.1 | |||||||||
| DW718480.1 | |||||||||
| Acan_isotig00013 | |||||||||
| AI111329.1 | |||||||||
| AS01868 | |||||||||
| TX01716 | |||||||||
| JI174587.1 | |||||||||
| HGC00258_1 | |||||||||
| AS03857 | |||||||||
| JI238470.1 | |||||||||
| MP01763 | |||||||||
| HCC12621_1 | |||||||||
| AE01320 | |||||||||
| PP02549 | |||||||||
| CB035486.1 | |||||||||
| ASC00698_1 | |||||||||
| DN557095.1 | |||||||||
| AI130654.1 | |||||||||
| SR04239 | |||||||||
| FE915329.1 | |||||||||
| AI061519.1 | |||||||||
| MI01926 | |||||||||
| MJC02669_1 | |||||||||
| AE01279 | |||||||||
| OVC04052_1 | |||||||||
| MJ05164 | |||||||||
| NAC00816_1 | |||||||||
| Name_isotig02067 | |||||||||
| PPC01793_1 | |||||||||
| AYC00414_1 | |||||||||
| FC821988.1 | |||||||||
| TCC02028_1 | |||||||||
| Associated_feature | WBsf999613 | ||||||||
| Experimental_info | RNAi_result | WBRNAi00053635 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||
| WBRNAi00018918 | Inferred_automatically | RNAi_primary | |||||||
| Expr_pattern | Expr1157192 | ||||||||
| Expr2024510 | |||||||||
| Drives_construct | WBCnstr00025007 | ||||||||
| Construct_product | WBCnstr00025007 | ||||||||
| Microarray_results (16) | |||||||||
| Expression_cluster (229) | |||||||||
| Interaction (11) | |||||||||
| Map_info | Positive | Positive_clone | T20D4 | Inferred_automatically | From sequence, transcript, pseudogene data | ||||
| Interpolated_map_position | V | -11.7992 | |||||||
| Reference | WBPaper00038491 | ||||||||
| WBPaper00055090 | |||||||||
| Method | Gene |
