WormBase Tree Display for Protein: CBP40952
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| CBP40952 | Peptide | CBP40952 | 1833 | 920148833 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DB_info | Gene_name | Cbr-UNC-77, isoform b | |||||||
| Molecular_weight | 211.8 | Inferred_automatically | build_pepace.pl | ||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis briggsae | |||||||
| Wormpep | |||||||||
| History | 256 | created | CBG05508b | ||||||
| Live | |||||||||
| Visible | Corresponding_CDS | CBG05508b | |||||||
| Homol | Pep_homol (120) | ||||||||
| Motif_homol | HMMPANTHER:PTHR46141 | hmmpanther | 4243 | 1758 | 1833 | 1808 | 1883 | ||
| 17 | 1760 | 17 | 1781 | ||||||
| HMMPANTHER:PTHR46141:SF2 | hmmpanther | 4243 | 17 | 1760 | 17 | 1781 | |||
| 1758 | 1833 | 1808 | 1883 | ||||||
| PFAM:PF00520 | pfam | 385 | 930 | 1210 | 2 | 239 | |||
| 84 | 376 | 8 | 242 | ||||||
| 1262 | 1527 | 4 | 244 | ||||||
| 429 | 651 | 2 | 239 | ||||||
| SUPERFAMILY:SSF81324 | superfamily | 0 | 1261 | 1521 | 0 | 0 | |||
| 81 | 374 | 0 | 0 | ||||||
| 929 | 1209 | 0 | 0 | ||||||
| 428 | 650 | 0 | 0 | ||||||
| INTERPRO:IPR005821 | interpro | 0 | 84 | 376 | 8 | 242 | |||
| 429 | 651 | 2 | 239 | ||||||
| 930 | 1210 | 2 | 239 | ||||||
| 1262 | 1527 | 4 | 244 | ||||||
| INTERPRO:IPR027359 | interpro | 0 | 71 | 204 | 8 | 113 | |||
| 419 | 537 | 4 | 109 | ||||||
| 926 | 1050 | 12 | 114 | ||||||
| 1249 | 1368 | 4 | 96 | ||||||
| INTERPRO:IPR028823 | interpro | 0 | 17 | 1833 | 17 | 1883 | |||
| Homol_homol | C27F2:wublastx_briggsae | ||||||||
| F17C8:wublastx_briggsae | |||||||||
| C11D2:wublastx_briggsae | |||||||||
| cb25.fpc4079b:wublastx_briggsae | |||||||||
| Feature | ncoils | 849 | 872 | 0 | |||||
| seg | 37 | 52 | 0 | ||||||
| 152 | 167 | 0 | |||||||
| 189 | 206 | 0 | |||||||
| 1066 | 1080 | 0 | |||||||
| 1617 | 1636 | 0 | |||||||
| 1667 | 1685 | 0 | |||||||
| 1704 | 1718 | 0 | |||||||
| tmhmm (20) | |||||||||
| mobidblite | 1657 | 1730 | 0 | ||||||
| 1687 | 1706 | 0 | |||||||
| 1792 | 1820 | 0 | |||||||
| 825 | 849 | 0 |
