WormBase Tree Display for Protein: CE18963
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| CE18963 | Peptide | CE18963 | 872 | -371273311 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DB_info | Database | TrEMBL | UniProtAcc | Q9XU67 | |||||
| UniProt | UniProtAcc | Q9XU67 | |||||||
| UniProt_GCRP | UniProtAcc | Q9XU67 | |||||||
| AlphaFold | entry | Q9XU67 | |||||||
| EnsEMBLGenomes | EnsEMBL_protein_id | T23F6.4.1 | |||||||
| Gene_name | RBD-1, isoform a | ||||||||
| Molecular_weight | 98 | Inferred_automatically | build_pepace.pl | ||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis elegans | |||||||
| Wormpep | |||||||||
| History | 15 | created | T23F6.4 | ||||||
| 244 | converted to isoform T23F6.4a | T23F6.4 | |||||||
| Live | |||||||||
| Visible | Corresponding_CDS | T23F6.4a | |||||||
| Homology_group | COG0724 | ||||||||
| KOG0110 | |||||||||
| meNOG08077 | |||||||||
| OMpre_WH009695 | |||||||||
| Homol | Pep_homol (197) | ||||||||
| Structure_homol | WBStructure013362 | ||||||||
| Motif_homol | HMMPANTHER:PTHR23003 | hmmpanther | 303.7 | 378 | 730 | 12 | 256 | ||
| PFSCAN:PS50102 | pfscan | 0 | 483 | 556 | 0 | 0 | |||
| 3 | 80 | 0 | 0 | ||||||
| 748 | 828 | 0 | 0 | ||||||
| 279 | 357 | 0 | 0 | ||||||
| 641 | 726 | 0 | 0 | ||||||
| SMART:SM00360 | smart | 382 | 4 | 76 | 1 | 121 | |||
| 175 | 242 | 1 | 121 | ||||||
| 749 | 824 | 1 | 121 | ||||||
| 484 | 552 | 1 | 121 | ||||||
| 280 | 353 | 1 | 121 | ||||||
| 642 | 722 | 1 | 121 | ||||||
| PFAM:PF00076 | pfam | 263.3 | 5 | 73 | 1 | 69 | |||
| 281 | 349 | 1 | 68 | ||||||
| 488 | 549 | 4 | 69 | ||||||
| 750 | 821 | 1 | 69 | ||||||
| 643 | 719 | 1 | 69 | ||||||
| SUPERFAMILY:SSF54928 | superfamily | 0 | 280 | 555 | 0 | 0 | |||
| 633 | 727 | 0 | 0 | ||||||
| 3 | 242 | 0 | 0 | ||||||
| 743 | 830 | 0 | 0 | ||||||
| INTERPRO:IPR000504 | interpro | 0 | 4 | 76 | 1 | 121 | |||
| 175 | 242 | 1 | 121 | ||||||
| 280 | 353 | 1 | 121 | ||||||
| 484 | 552 | 1 | 121 | ||||||
| 642 | 722 | 1 | 121 | ||||||
| 749 | 824 | 1 | 121 | ||||||
| INTERPRO:IPR012677 | interpro | 0 | 1 | 122 | 34 | 121 | |||
| 176 | 243 | 8 | 74 | ||||||
| 244 | 368 | 49 | 156 | ||||||
| 474 | 635 | 5 | 94 | ||||||
| 636 | 744 | 8 | 100 | ||||||
| 745 | 856 | 6 | 103 | ||||||
| INTERPRO:IPR035979 | interpro | 6.28e-26 | 3 | 242 | 0 | 0 | |||
| 5.3e-31 | 280 | 555 | 0 | 0 | |||||
| 7.52e-16 | 633 | 727 | 0 | 0 | |||||
| 5.51e-20 | 743 | 830 | 0 | 0 | |||||
| Feature | ncoils | 381 | 401 | 0 | |||||
| 850 | 870 | 0 | |||||||
| mobidblite | 569 | 604 | 0 | ||||||
| 562 | 637 | 0 | |||||||
| 845 | 872 | 0 | |||||||
| 356 | 403 | 0 | |||||||
| 404 | 0 | ||||||||
| 618 | 637 | 0 | |||||||
| 95 | 129 | 0 | |||||||
| Contains_peptide (29) |
