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WormBase Tree Display for RNAi: WBRNAi00061421

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Name Class

WBRNAi00061421HomolHomol_homolY111B2A:RNAi
Sequence_infoDNA_textataaattaatggtacacaaacacacaacggagagaatggaaatatcacgaattaggggaaaaagtggggtgggaaaaggcaactagaagagatgggggggacccgttaaaaagtttcaatttataaaaatattcttcttcgatttctctataatttcgatacttcattatcaacaattggtttatcgacgcggccgggatcgttgaccacttgaactgctttcttgtaccattcggctccatttttatgaacatcttccgtttttttcgcgactagttcgtcgggttttcctggaaaaattcgtactttgttttatgatactctcaaaataatcgagattgcagaaaaaaaaccgcccgaccaatcaggtgattcgctccgcccacttttcaaccaatcaggtgtagttggcggagtttgaaagcgctgattggtcggggagtcacggacgtcgtctggcttccctcataaattgaaatggaagagtttttgccgaactaggccattttggctcggccatatctggggtagatttacggcgcgttgcgtgtcgcgtcgcggctcgattttagttgtgtaaaactaactaaaaaaacaattttttgtccttcaaaaactgaaaaattttcgtttctcgattttagaagaaaaaaccgaaaaatttaacaattttcaattttttttttttaaataattttttgattttctaaatttcgaaaaatgcaaaaaacagttagttcttagagctttttattcattttattgcgtttttcggaaaaaactttttttttgttcttttttttttatattttgagggaaaaaaatcgatttttctaaattttttgcaattttttcctatttttgaagaaaattattagtttgcttatgtttttttttcagaaaaaaaattgtgaaatttttttttgttaaacatttttttgagttttcttttattacgagggaacgcaaaattccgagaatgcgtattgtgcaacatatttgacgcgcaaaatatctcgtagcgaaaactacagtaatgactacgtttgtgtcgatttacgggctcgatttttaaaataatgtatttatcgatagaatgaatattaaaactaagcaaatttcgaaaaccgagcccgtaatcgatgtacgggctcgattcacaagcgcgctacagtagtcattactgtagttttcgctacaagatattttgcgcgtcaaatatggcgtgcaatacgcattctcagaatttcgtgttccccgtaataaactaattgcataatttttaatacaaatttctggcttccctcgtaatttgaaatggaagagtttttgccgaatttcggccattttggctcggccatatctggatagatttacggcgcgttgcgtgtcgcgtcgcgtcgcggctcgattttagttgatttttaggtcaaattttgagattcagtggttttctgaaatttgcaatctcctgaccaaaaaatggataattcagcaattctgtataactttttcgctgcaaaaaacattgtaaaacttgataaattatatttaaggtgaaaagtgggccaatttataattctaaactgaatttggctaaatttttcggttttcagggtgaaaattgttgaaaaatgggccaaattgactaatataccatgcttttaggtggaaaattgacttttcaagcggatttgcggatttttcacaggaaaacttgcaaaaatttaacacggatttccggcttccctcataaattgaaatggaagagttttttgccgcgaactaggccattgttggctcggccatatctggggtagatttacggcgcgttgcgtgtcgcgtcgcggctcgattttagttgtaaaactaactaaaaaaacaattttttgtccttcaaaaactgaaatattttcgtttctcgattttagaagaaaaaaaccgaaaaatttaacaattttcaattttttttaaaataattttttgattttctaaatttcgaaaaatgcaaaaaacagttagttcttagagcttttttattcattttattgcgtttttcggaaaaaactttttttgttccttttttttgatattttgagggaaaaaatcgatttttctaaattttttgcaattttttcctattttttgaagaaaattattagtttgcttatgtttttttttcagaaaaaaaattgtgaaatttttttcagaatcccgaatcaagaattttcgatttccactagaaaccctgaccatagtttggtggatttgcattcggatcatatcctaatctccttaacatcggcgcaaccgaatccatatcagcaacaacatcctcaggaatcgttccaacccatttgataagagcatcaagattaaccggtttaacgacttgatccgagctccgttccacattcgataaagaaatatcttttccaataagctgctcatggtgcagcactttatcatcccacggaatatccaaaaactctgtaattcgccgcatttgtgcttccggatgtagcaccagctgctcataatacactttcaaacaatttttctctccaaccgattcacactgatctaccattatttgaattgccgcattccatttcgtcatgcattgacggaaatcgttcaaatcgaatccggtaattgtgacttttcgtgagattatactattcacggtggcccgtccatcacggatcattagaagatatttggcatttgggaagagttcttttaggtagacggctgatttcattgtgaatggatccttgttgcagagacgaggagcccgatctccgtggccaaccattatctgatgaaaaaaaaattaaattgttaaaattggcggttttcactaaaacttcctataaaagctgaatttttaggggttttcacgtggcttgctctacgtcttgatctacaaaaaatgcggcagagttatcaactgatttcgcatggttaaaaacgtgctgacgtcacattttttggacaaaaaaatcccgcattttttgtagatcaaaccgtaatgggacagcctggcacactacgtgggtttttagatttttgtaaaataaaaatatttttctttcgatttttgaaaaaaaagtttttttttttcgatatttctctttttctttttttaataaatttttaaatgatttttctctataaataaaaacaaaaaaaaaatacttttcaaggtaagatttttattgaattttatttttaattttaaattaaagaaattaattaattaattaacttttttgaatttttaaaattagattaattttttttttaatttcggagttttgttcggcaaaaattgactttcggtttttagttttttggtaaaatcagatacatttttctcggatttttttacctttttttggttgtactttggtagtttttgtggtttttaaagatttttttttagaaaaaaaaaattttacctttgccaaaaatttactattttcggtttattatctgtttactatcacttttgttttttttttgtaaaattcaattttttcgtgtgtttcgggctttttttggtggttttttagaaggttttctatgattttttcgggtttttttgatgtagattatactataaaaccgtctgctacctaattttaaaaaatgatgaattttttttttaattaaaaattaatataaaatttaaaaaatttgcatttttggcgtctatttgaaagtttaaaaaaaatctttttttacagaattatgttttccggcaatattctagttttaaaaaccgatctgaaattttccagataattttttttcacaaaatactgttttttatgattatgatttttaaattgttttggagtaggcaaatatttttttttttatttgttccaccacaacaattttaacgttattttttttccgaaaaatctccaaaaatccagaaaatattctcagtgctcagaagtgtatgtctcacctccatgataaacgagctgatcgcattgttaatcacttcacccgtcactccagcctgctgcagtcgattccactccttttccgactttttccattgtgaccgtagattcaggatgcgtggaatgacacgtgtctcctcaccacatctgacttctggatgagcgtcaagcatcgcacgcatcagagttgtaccggagcgaggaacaccacctgaaatgttgaattatagatcaaaacttgacctgaacaacagtaaaacggtacacatgacactaggtaccaacaaaaaggactttacgtactcgataaacgggcaaactaacagaaaagaagatgtcgctagagatttaggttttctcatcgctccaaatctaaaattcacggagcattggaaaaaagcaataaatgcatccaaatatcaacttagtcaaatatttaatatgtataacagtagaaacccaagattggtgaccttgctttacaagacatttgttagacctcttcttgagtatggaacggtaattactagcccaattagaaactctgaaacaagagccattgagtcagttcaaaacgcatttactagacgattatacagtagaacacaaggcaaatacatctcgccaactgacccggagtataaatctgcatccgaacgcaatgaactttttgagctcacaacactacaaacgcggcgccaaatctatgacagaaaaactattatgaagatgattaatggtaaactagatctcaacgtacctcaattttttacatattctgaaaacacacgaacaccgttccaaaaagaaagtctcatggagcagatgtaaaactaaaactagaaagcattttattgtaaaccgtacgctgagtaaccccaagtttctaaaacatatatcagatcttgaataacgagatgtctgacaactgatgattgcaacatggactacccatataacattatttcctcccgcctgacctaacggttctgttaacaa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ExperimentDate10 Nov 2004 00:00:00
StrainWBStrain00000001
Delivered_byInjection
InhibitsPredicted_geneY111B2A.15Inferred_automaticallyRNAi_primary
GeneWBGene00013737Inferred_automaticallyRNAi_primary
TranscriptY111B2A.15.1Inferred_automaticallyRNAi_primary
SpeciesCaenorhabditis elegans
ReferenceWBPaper00024673
PhenotypeWBPhenotype:0000054PenetranceRange47
WBPhenotype:0000062Remarkadult lethal
PenetranceRange3
WBPhenotype:0000643Remarklittle or no movement
WBPhenotype:0000948RemarkCuticle defects that include what the authors term belting (parts of the cuticle do not detach) and the dityrosine level was decreased, indicative of less tyrosine cross-linking.
RemarkEntire sequence of clone used for RNAi not known as only the ends of the sequence were determined. The only target shown is the best match.
MethodRNAi