WormBase Tree Display for Sequence: Cjap.Contig17796
expand all nodes | collapse all nodes | view schema
Cjap.Contig17796 | DNA | Cjap.Contig17796 | 383889 | |||
---|---|---|---|---|---|---|
SMap | S_child | Gene_child (47) | ||||
CDS_child (132) | ||||||
Transcript (50) | ||||||
Pseudogene | CJA47568 | 114974 | 115044 | |||
CJA47569 | 175439 | 175511 | ||||
CJA47570 | 251760 | 251831 | ||||
Feature_object (29) | ||||||
Feature_data (25) | ||||||
Homol_data | Oligo_set:Cjap.Contig17796:AGILENT | 1 | 383889 | |||
BLAT_EST:Cjap.Contig17796 | 1 | 383889 | ||||
BLAT_EST:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_EST:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_EST:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
BLAT_mRNA:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_mRNA:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
BLAT_Trinity:Cjap.Contig17796 | 1 | 383889 | ||||
BLAT_Trinity:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_Trinity:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_Trinity:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig17796 | 1 | 383889 | ||||
BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
BLAT_mRNA:Cjap.Contig17796 | 1 | 383889 | ||||
BLAT_mRNA:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_OST:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_OST:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_OST:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
BLAT_tc1:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_RST:Cjap.Contig17796 | 1 | 383889 | ||||
BLAT_RST:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_RST:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_RST:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
BLAT_Nanopore:Cjap.Contig17796_1 | 1 | 150000 | ||||
BLAT_Nanopore:Cjap.Contig17796_2 | 150001 | 300000 | ||||
BLAT_Nanopore:Cjap.Contig17796_3 | 300001 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_brenneri | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_briggsae | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_brugia | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_fly | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_human | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_japonica | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_ovolvulus | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_pristionchus | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_remanei | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_slimSwissProt | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_sratti | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_tmuris | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_worm | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:wublastx_yeast | 1 | 383889 | ||||
Cjap.Contig17796:RepeatMasker | 1 | 383889 | ||||
DB_info | Database | NDB | NDB_ID | Scaffold17796 | ||
NDB_AC | GL474944 | |||||
NDB_SV | GL474944.1 | |||||
Origin | From_laboratory | RW | ||||
Species | Caenorhabditis japonica | |||||
Properties | Genomic_canonical | |||||
Checksum | MD5 | d016387ad33e04f869713f35b68b4092 | ||||
Method | Genomic_canonical |