WormBase Tree Display for Sequence: Cjap.Contig18213
expand all nodes | collapse all nodes | view schema
| Cjap.Contig18213 | DNA | Cjap.Contig18213 | 720316 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| SMap | S_child | Gene_child (134) | ||||
| CDS_child (248) | ||||||
| Transcript (153) | ||||||
| Pseudogene | CJA48132 | 656190 | 656262 | |||
| Feature_object (117) | ||||||
| Feature_data (37) | ||||||
| Homol_data | Oligo_set:Cjap.Contig18213:AGILENT | 1 | 720316 | |||
| BLAT_EST:Cjap.Contig18213 | 1 | 720316 | ||||
| BLAT_EST:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_EST:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_EST:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_EST:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_EST:Cjap.Contig18213_5 | 600001 | 720316 | ||||
| BLAT_mRNA:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_mRNA:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_Trinity:Cjap.Contig18213 | 1 | 720316 | ||||
| BLAT_Trinity:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_Trinity:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_Trinity:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_Trinity:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_Trinity:Cjap.Contig18213_5 | 600001 | 720316 | ||||
| BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig18213 | 1 | 720316 | ||||
| BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_IsoSeq:Cjap.Contig18213_5 | 600001 | 720316 | ||||
| BLAT_mRNA:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_mRNA:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_mRNA:Cjap.Contig18213_5 | 600001 | 720316 | ||||
| BLAT_ncRNA:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_ncRNA:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_OST:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_OST:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_OST:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_OST:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_OST:Cjap.Contig18213_5 | 600001 | 720316 | ||||
| BLAT_tc1:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_tc1:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_RST:Cjap.Contig18213 | 1 | 720316 | ||||
| BLAT_RST:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_RST:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_RST:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_RST:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| BLAT_RST:Cjap.Contig18213_5 | 600001 | 720316 | ||||
| BLAT_Nanopore:Cjap.Contig18213_1 | 1 | 150000 | ||||
| BLAT_Nanopore:Cjap.Contig18213_2 | 150001 | 300000 | ||||
| BLAT_Nanopore:Cjap.Contig18213_3 | 300001 | 450000 | ||||
| BLAT_Nanopore:Cjap.Contig18213_4 | 450001 | 600000 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_brenneri | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_briggsae | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_brugia | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_fly | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_human | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_japonica | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_ovolvulus | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_pristionchus | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_remanei | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_slimSwissProt | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_sratti | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_tmuris | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_worm | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:wublastx_yeast | 1 | 720316 | ||||
| Cjap.Contig18213:RepeatMasker | 1 | 720316 | ||||
| DB_info | Database | NDB | NDB_ID | Scaffold18213 | ||
| NDB_AC | GL475361 | |||||
| NDB_SV | GL475361.1 | |||||
| Origin | From_laboratory | RW | ||||
| Species | Caenorhabditis japonica | |||||
| Properties | Genomic_canonical | |||||
| Checksum | MD5 | 58701c534dc9672bec4f307514362615 | ||||
| Method | Genomic_canonical |
