WormBase Schema for Model: Sequence
expand all nodes | collapse all nodes
?Sequence | DNA | UNIQUE | ?DNA | UNIQUE | Int | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SMap | S_parent | UNIQUE | Canonical_parent | UNIQUE | ?Sequence | XREF | Genomic_non_canonical | |||||||
Genomic_parent | UNIQUE | ?Sequence | XREF | Nongenomic | ||||||||||
AGP_parent | UNIQUE | ?Sequence | XREF | AGP_fragment | ||||||||||
S_child (15) | ||||||||||||||
Structure (8) | ||||||||||||||
DB_info (7) | ||||||||||||||
Origin | From_database | UNIQUE | ?Database | UNIQUE | Int | |||||||||
From_author | ?Author | XREF | Sequence | |||||||||||
From_laboratory | UNIQUE | ?Laboratory | ||||||||||||
Genetic_code | UNIQUE | ?Genetic_code | ||||||||||||
Date | DateType | Text | ||||||||||||
Date_directory | UNIQUE | Text | ||||||||||||
Life_stage | UNIQUE | ?Life_stage | ||||||||||||
Species | UNIQUE | ?Species | ||||||||||||
Library | UNIQUE | ?Library | ||||||||||||
Strain | UNIQUE | ?Strain | ||||||||||||
Anatomy_term | ?Anatomy_term | |||||||||||||
Analysis | UNIQUE | ?Analysis | ||||||||||||
Read_coverage | UNIQUE | Float | ||||||||||||
Visible (15) | ||||||||||||||
Properties | Genomic_canonical | Gene_count | UNIQUE | Int | ||||||||||
Briggsae_canonical | ||||||||||||||
Genomic | ||||||||||||||
Checksum | MD5 | UNIQUE | Text | |||||||||||
CRC64 | UNIQUE | Text | ||||||||||||
cDNA | cDNA_EST | |||||||||||||
EST_5 | ||||||||||||||
EST_3 | ||||||||||||||
Capped_5 | ||||||||||||||
TSL_tag | ||||||||||||||
EST_consensus | ||||||||||||||
RNA | UNIQUE | mRNA | UNIQUE | Processed_mRNA | ||||||||||
Unprocessed_mRNA | ||||||||||||||
tRNA | Type | UNIQUE | Text | |||||||||||
Anticodon | UNIQUE | Text | ||||||||||||
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snRNA | UNIQUE | Text | ||||||||||||
snoRNA | UNIQUE | Text | ||||||||||||
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Ignore | #Evidence | |||||||||||||
Show_in_reverse_orientation | ||||||||||||||
Status | Received | UNIQUE | DateType | |||||||||||
Library_construction | UNIQUE | DateType | ||||||||||||
Shotgun | UNIQUE | DateType | ||||||||||||
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Contiguous | UNIQUE | DateType | ||||||||||||
Finished | UNIQUE | DateType | ||||||||||||
Submitted | UNIQUE | DateType | ||||||||||||
Annotated | UNIQUE | DateType | ||||||||||||
Archived | UNIQUE | DateType | UNIQUE | Text | ||||||||||
Match_type | UNIQUE | Match_with_function | ||||||||||||
Match_without_function | ||||||||||||||
Link | ||||||||||||||
Splices (3) | ||||||||||||||
Cluster_information | Contains_reads | ?Sequence | XREF | Contained_in_cluster | ||||||||||
Contained_in_cluster | ?Sequence | XREF | Contains_reads | |||||||||||
Map | ?Map | XREF | Sequence | #Map_position | ||||||||||
Interpolated_map_position | UNIQUE | ?Map | UNIQUE | Float | ||||||||||
Oligo | ?Oligo | XREF | In_sequence | Int | UNIQUE | Int | ?Method | |||||||
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Homol | DNA_homol | ?Sequence | XREF | DNA_homol | ?Method | Float | Int | UNIQUE | Int | Int | UNIQUE | Int | #Homol_info | |
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Homol_homol | ?Homol_data | XREF | DNA_homol | ?Method | Float | Int | UNIQUE | Int | Int | UNIQUE | Int | #Homol_info | ||
Method | UNIQUE | ?Method |