WormBase Tree Display for Protein: JA57681
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| JA57681 | Peptide | JA57681 | 866 | -453276008 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DB_info | Database | TREEFAM | TREEFAM_ID | TF321506 | |||||
| Gene_name | Cjp-UNC-40, isoform b | ||||||||
| Molecular_weight | 93.5 | Inferred_automatically | build_pepace.pl | ||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis japonica | |||||||
| Wormpep | |||||||||
| History | 227 | created | CJA07019b | ||||||
| Live | |||||||||
| Visible | Corresponding_CDS | CJA07019b | |||||||
| Homol | Pep_homol (131) | ||||||||
| Motif_homol | HMMPANTHER:PTHR13817 | hmmpanther | 762.1 | 597 | 782 | 1436 | 1637 | ||
| 1 | 230 | 687 | 928 | ||||||
| 291 | 587 | 1026 | 1376 | ||||||
| 803 | 851 | 1747 | 1819 | ||||||
| HMMPANTHER:PTHR13817:SF116 | hmmpanther | 762.1 | 1 | 230 | 687 | 928 | |||
| 597 | 782 | 1436 | 1637 | ||||||
| 803 | 851 | 1747 | 1819 | ||||||
| 291 | 587 | 1026 | 1376 | ||||||
| PFSCAN:PS50853 | pfscan | 0 | 18 | 113 | 0 | 0 | |||
| 222 | 312 | 0 | 0 | ||||||
| 341 | 434 | 0 | 0 | ||||||
| 118 | 213 | 0 | 0 | ||||||
| 437 | 536 | 0 | 0 | ||||||
| PRINTS:PR00014 | prints | 0 | 33 | 42 | 0 | 0 | |||
| 145 | 155 | 0 | 0 | ||||||
| 387 | 405 | 0 | 0 | ||||||
| 509 | 523 | 0 | 0 | ||||||
| SMART:SM00060 | smart | 227.6 | 435 | 522 | 1 | 69 | |||
| 19 | 100 | 1 | 69 | ||||||
| 339 | 416 | 1 | 69 | ||||||
| 220 | 299 | 1 | 69 | ||||||
| 115 | 200 | 1 | 69 | ||||||
| PFAM:PF00041 | pfam | 221.2 | 341 | 421 | 2 | 84 | |||
| 231 | 299 | 12 | 82 | ||||||
| 436 | 525 | 1 | 85 | ||||||
| 21 | 102 | 2 | 84 | ||||||
| 118 | 203 | 2 | 85 | ||||||
| SUPERFAMILY:SSF49265 | superfamily | 0 | 340 | 531 | 0 | 0 | |||
| 18 | 211 | 0 | 0 | ||||||
| 219 | 309 | 0 | 0 | ||||||
| INTERPRO:IPR003961 | interpro | 0 | 19 | 102 | 1 | 84 | |||
| 115 | 203 | 1 | 85 | ||||||
| 220 | 299 | 1 | 82 | ||||||
| 339 | 421 | 1 | 84 | ||||||
| 435 | 525 | 1 | 85 | ||||||
| INTERPRO:IPR013783 | interpro | 0 | 17 | 106 | 9 | 94 | |||
| 107 | 218 | 6 | 116 | ||||||
| 219 | 312 | 9 | 96 | ||||||
| 337 | 432 | 7 | 101 | ||||||
| 434 | 532 | 1 | 94 | ||||||
| INTERPRO:IPR036116 | interpro | 0 | 18 | 211 | 0 | 0 | |||
| 219 | 309 | 0 | 0 | ||||||
| 340 | 531 | 0 | 0 | ||||||
| Homol_homol | T19B4:wublastx_japonica | ||||||||
| Cjap.Contig905:wublastx_japonica | |||||||||
| Cjap.Contig16566:wublastx_japonica | |||||||||
| Cjap.Contig16616:wublastx_japonica | |||||||||
| Feature | seg | 67 | 79 | 0 | |||||
| 318 | 340 | 0 | |||||||
| 430 | 438 | 0 | |||||||
| 570 | 591 | 0 | |||||||
| 595 | 604 | 0 | |||||||
| 616 | 625 | 0 | |||||||
| tmhmm | 572 | 594 | 0 | ||||||
| mobidblite | 669 | 694 | 0 | ||||||
| 663 | 694 | 0 | |||||||
| 316 | 345 | 0 | |||||||
| 426 | 458 | 0 | |||||||
| 715 | 737 | 0 | |||||||
| 110 | 132 | 0 |
