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WormBase Tree Display for Variation: WBVar02122043

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Name Class

WBVar02122043NamePublic_nameWBVar02122043
Other_namecewivar00852966
Sequence_detailsSMapS_parentSequenceY59A8B
Flanking_sequencesTTAAAGTACATTTAAAGTAGAAATTGGTTATTGCCCAATTGCGGGAAATTATCGATTCCGGCAAATTGCATGTTTGCCCAATTTGCCGAAAACTTTCAATTCCGGCAAATTGCCGATTTTTCGATTCCGGCACATTTCAGATTTTCCAATATGCCGGATATTTGCAATTCCGGCAATATGCCGATTTTCCGCTTTGCCGGAACTTTCCAATACCGGCAAATTGCCGATTTTCCGATATGCCGGAAATTTTCAATTCCGGCAAATTGCCGATTTGCCGGAATTTTTCTATTCCGGCAAGTTGCCGATTTTCGGAAAATTTTCATTTTTGGCGATTTGCCGGAAATTTTCAATTCCGGCCAGTTGCCGATTTGCCAGAAATTATAAATTCCGGCCAGTTGCCGATTTGCCAGAAATTATGAATTCCGGCAAATTTCCATTTTGCCGGAAATTTTCAATTCCGGCAAATGCAGGTTTGCCTAATTTGCCGGAAATTTTCAATTCCGGCCAGTTGCCGATTTGCCAGAAATTATGAATTCCGGCAAATTTCCATTTTGCCGGAAATTTTCTATTCCGGCAAATTTCCATTTTGCCGGAAATTTTCAATTCCGGCAAATGCAGGTTTGCCTAATTTGCCGGAAAATGTTCCATTCCGGCAATCTGCCGATTTTTGGCGATTTGCCGGAAATTTTCTGCAAATCGCATGATGATTGCCTAATTTGCCGGAATAATTCAATTCCGGCAAAATGCCAAATGCTTGCCACCCACCTCTCTGTTTCATACTAGTTTATTTCGAAAAAAAAATTTTTTTCTGAAATAAAAAAAAATACACTAAATTTTTTGAAAATTGAAATTTTTAATTAAAAAAAACTTTTTTTTTTTCAGAAAACCAGTGACCACAATGAGAACTCCAGCCGCCACCCCGGCTGCTCCACCAACCCGTCCAACTCCATCCCGTTCTTCAGCTGCTCCGAGAGCAACAGCTCCAACTCCAACAGCAGCACCTCCAAAAACTTGTGCACCGCCCGTTCGTTCTGCATCAACCGTAGCAGCGGCTGCTGCTGCTGCACCACCGGGAGTCGATATGGCGACATTTAATAAATTAAAAGAAGAACTGGAAGAAGTTACACGTCAGCTGACAGAATCTGACAATGTTATTGCAAGTCTGGAAAAAGAAAGAGACTTTTATTTTAGTAAACTTCGAACGATTGAAGTTATTTGTCAGGATAATGAATCGATTGGAAATGTTGAAGTTAATCGAGTTTTGGAGGTAAAAATTGATGAAAATTGGGAAAAACTACCGAAAGTAGCCTGAAATTTGGATCAGGGATGTGCGGCAAATTTGCCGAATTTGCCGAATTTGCCGAATTTGCCGAGCTCGGCAAATTTCAAAAAAGTAGATTTGCCGAATTTGCCGCACACGTCAAAAATTTTACAGTACAATTTTGACTAAAACTATTGATTTTTTAGCCAAAAATTTAGTAAAATGACACAAAATTGACTTAGTTTTATGCTTAAACAGACATACTACGCGGAACTTATTCAGAAACCAGATGTGTGTTAAGAATTCAGTAGATTTGGTGCTCCAAAAAACATAAAAAATATCAAATTTTTTCGAGTTTTGCACGGCAAATTTGCCGAATTTGCCGTTTGCCGAGCTCGGCAAATTTTGAGATTTGCCGCACACCCCTGATTTGGATTTAGAATGTTTAGAAAAGAGCAATTTTAGAGATAAAATTCAAGAAATTTAAAAAATTCCGAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAGTCAAAAAAGTGAGACTTTTTTGAAAATTTTGATTTTTTTTAATTTAGAAAATTCTCGAAAATTTGAAAAAAAATTCAAATTATTCGGAAAATTGCGTATATTTGTGTGAAAAATAAAAAAAAATAATTTAAAAATTCCGAAAATTTGAAGAAAGTATGTTTAAAACATTTTTTTAATTGAAAAATTCCGGAAATTTCAAAAAAAAAATTTTGTTTGAAAACATATGAAAAACTATTTAAAGTATCAATTTTTAGATAAAATTCAAGAAATTTCAAAAATTCCGAAAATTCCAAAATTTTTGATAATTGCTCATTTCCAACAATATCAAAAATGAAAAAAAGTGAAAATTTTGTTGAAAATTTAAATTTTTTTTTTTAATTTAGAAAATTCTCGGAAAATTGCGTATATTTGTGTGAAAAATTCCTAAAGTGAGATTTTTCGGAAATTTTCATTTTTGGCGATTTGCCTAATATGCCGGAAATTATCAATTCCGGCAAATTGCCGTTTTTCCGATTTGCCGGAAAAATTTGAAACATTTGGGAAAAAAATTGTTTTTGAAATTTTTAAAAATAATTATCTATGTAAATTAAAAAAAATATATATATATGTATATAACTTTTTTATTTAAAAATTCCGAAAATTCGAAAAAAAAACATATGTTTGGAAATTTCAACTTTTTTATTTACAAAAAAATTTAAACTTCAAAAAAAATCTGCTTTGAAAATTTATGAAAAAATATTTAAAGTAGCATATATATTTGCAAAACATTGAAAATTTGGCTGAAAAAACTGAAAATTTAATCAATTTTGAAAATAAAAAAATGTAAATTTTGAAAATAAAAAAAACTTTCAAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAAGTAAAAAAGTGAGACTTTTTTTGAAAATTTAAATTTTTTAAATTTAGAAAATTCTCGGAAATTTGAAAAAAAAGAACAATTATTCGTAAAATTGCAAATATTTGTGTGGAAAATGTGTGGAAATTAAAAAAAAATTTCATCTAAAAATTCCCAAAATTTGAAGAAAGTATGTTTGAAACATTTCATTAATTTTTTTTATAATTAAATTCCGGAAATTTCAAAAAAAAAAATTTTGTTTGAAAACATATGAAAAACTATTTAAAGTATCATCAATTTTTAGATAAAATTCAAGAAATTTCAAAAATTCCAAAATTTTTGATAATTGCTAATTTCCAACTATATCAAAGTCAAAAAAGTGAAAATTTTGTTGAAAATTTTGAATTTTTTTTAAATTCAGAAACTTTATAAGAAAAACAACCAAAGGTAACTTTTTAGTATATTTTTTCATTGGAAATTTTGAAGAAAATTTTTTAAAAATAAAACTTCTCGAAAATTTGAAAAAAAAATAAAATTCGAAAGTTACGTATATTTGTGTGAAAAAAACGTTTTTTATTTCAATTTAAAAAATTCCTAAAATTTTGAAAAAATATCAACCGAAAAAAAACATTTTTTTTAAATGAAAATTCTCGGAAAGTAGCGAAAAATTCCGAAAGTGATGCATATTCACAAAAAAAATTATTTTTTATTTAATAAAAAAACGTAATTTTGAAACATTTTTTTGTTTAAAAATGTTTTTTTTTATTTACAAAAAAAATTAAAATTCCGGAAAAGTCTGAAATTGAATATTAAAAAAAAAAAGAAAACAGCAATTTATCCCTTAATTTTGAAAAATATTCAATTTCGACATTTTACTTTTTTTAAAATTAGATTTAAAATTTCTGAAAATTTGCAGAAAAAACTGAAAAAATAACTACCCCGAAAAAAAAGTTCTTAAAAACATATTTCCAGGTTCTCTACGAGACGGAAGAAGGATTCGCACCACCAGAAGACGAGGCAAATGGCGGAGCAGAAGCCGAAGAATTCTAAACTATTTAATATTTTCTCTATTGTTTAATTCCAGCTTTCAAGCCAAGCTTCTACCCAAACACTTCAATTTTACTCCCAAAAAAATATGCGATTTTACAATGTTATATTTCACCGAAAACCCCCTCTGCTTATAATTATAGTTAACTTATTAATTTTCATGAACTTATTCAATAACTGCACCAAATTGGCCGCCGCTTCTTCTTTTCCACTTGAAATTTTCAGTTTTTCTTTTTTCATTCTTCCATCCCAACACCTATGACATTGTCAGTATTTTAATTGATTGGCTTTCAATTTTTTTTCGATTTTAAAAATCATTTCCTTTTTTTCACCGAACATTTAACGCTTTTTTCTAATTGTTACGTCGTGCTTTTCTTTGTGCTAAAATAAATTATGATATTTAAAAAAGAATTTTGCTTCCTTCAAACAAAAATTTCAAAAAATGATGGGTCTGCTAAATACATTTTGTAGTTTGTAGTCTGGCATACCCACTTAGTAAAATCATCAGTTTTTGCTGTAATTTTGAACAGTTTTCCCTTAAATTTTGCATTTTCTCGGGATTTGAATGTGACAATTCATGAAAATTTACTCAAAAAATCGATTTTTCGCATAGAAAATATTGGAATTTTGGGATTTAAATTTGTAGTCGTTGATCATATTTTCAAAATGCTCCAAACAGACAAATTTTAAGTTTAGAGCAAAAATTGATTGACAAAACGATGAAAATATGCCCAACGACTCCAAATTCCAATTTTTAAAGTCTTTATCTACACTCATTTTTTCTATTTTCTTTTCTGAGCACACCATAACTGGTTAGATGCTTGGGTCTGCTAAATATTTTTGTGTAGTTTGTAGTCTGGCAAACCCACTCGGTGAAAATGGCCAATTTTGCTGTAATTTTAAGAGGTTATCCTGATTTTTGGCGGGAAAAATCTCAAAATGTGCATTTTCTCGGAGCATGTAATTGAAAATTTACTCAAAAAAATCGATTTTTCGCTTAGAAAATATTTGAATTCGGCAAAATTATGCATAAAATCACAATTTAACCCGTCTGAAAACCCGAAAATCCACATTTTTCATCGATTTTCTGTTAAAAATCTGCTTATTTTCACCTGAAAACACAAAATTTAGTCGAAAAAATGATGGGTCGGCTAAATAATTTTGTGTAGTTTGTAGTCTAGCAGACCGGAAACGATTATTTTTCGATTTTTCTTTTTTTTTTAACCCAAAAGTTTGGGTCTGCTAAACATTGTTGTGTAGTTTGTAGTGTGGCAG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Mapping_targetCHROMOSOME_V
Source_location225CHROMOSOME_V1804500118057000From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
Type_of_mutationDeletion
SeqStatusSequenced
Variation_typeNatural_variant
OriginSpeciesCaenorhabditis elegans
StrainWBStrain00006637From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
WBStrain00023286From_analysisMillion_mutation_project_reanalysis
LaboratoryVC
AnalysisMillion_mutation_project_reanalysis
StatusLive
AffectsGeneWBGene00007062
WBGene00305846
WBGene00305847
WBGene00044794
WBGene00013344
WBGene00305845
TranscriptY59A8B.9.1
Y59A8B.25.1
Y59A8B.45
Y59A8B.7.1
Y59A8B.44
Y59A8B.46
RemarkThe boundaries of this variant have been identified only approximately
This allele is a copy number variation determined from whole-genome sequence data, and should be assumed to be non-homozygous
MethodWGS_Flibotte