WormBase Tree Display for Variation: WBVar00143017
expand all nodes | collapse all nodes | view schema
| WBVar00143017 | Name | Public_name | e184 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Other_name | e184sd | ||||||||
| Sequence_details | SeqStatus | Pending_curation | |||||||
| Variation_type | Allele | ||||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis elegans | |||||||
| Strain (68) | |||||||||
| Laboratory | CB | ||||||||
| Status | Live | ||||||||
| Affects | Gene | WBGene00001074 | |||||||
| Interactor | WBInteraction000052056 | ||||||||
| WBInteraction000052059 | |||||||||
| WBInteraction000517612 | |||||||||
| WBInteraction000517732 | |||||||||
| WBInteraction000517733 | |||||||||
| Genetics | Mapping_data | In_2_point | 99 | ||||||
| 104 | |||||||||
| 105 | |||||||||
| 106 | |||||||||
| 107 | |||||||||
| 108 | |||||||||
| 109 | |||||||||
| 110 | |||||||||
| 111 | |||||||||
| 112 | |||||||||
| 113 | |||||||||
| 114 | |||||||||
| 115 | |||||||||
| 116 | |||||||||
| 142 | |||||||||
| 227 | |||||||||
| 228 | |||||||||
| 316 | |||||||||
| 322 | |||||||||
| 323 | |||||||||
| 364 | |||||||||
| 366 | |||||||||
| 409 | |||||||||
| 429 | |||||||||
| 436 | |||||||||
| 438 | |||||||||
| 445 | |||||||||
| 451 | |||||||||
| 484 | |||||||||
| 517 | |||||||||
| 523 | |||||||||
| 556 | |||||||||
| 559 | |||||||||
| 595 | |||||||||
| 645 | |||||||||
| 648 | |||||||||
| 712 | |||||||||
| 794 | |||||||||
| 986 | |||||||||
| 987 | |||||||||
| 1634 | |||||||||
| 1642 | |||||||||
| 1645 | |||||||||
| 1647 | |||||||||
| 1648 | |||||||||
| 1649 | |||||||||
| 1688 | |||||||||
| 1689 | |||||||||
| 1690 | |||||||||
| 1691 | |||||||||
| 1692 | |||||||||
| 1693 | |||||||||
| 1694 | |||||||||
| 1695 | |||||||||
| 1696 | |||||||||
| 1697 | |||||||||
| 1698 | |||||||||
| 2726 | |||||||||
| 2838 | |||||||||
| 2839 | |||||||||
| 2840 | |||||||||
| 3276 | |||||||||
| 3277 | |||||||||
| 3730 | |||||||||
| 4236 | |||||||||
| 6163 | |||||||||
| In_multi_point (117) | |||||||||
| In_pos_neg_data | 2162 | ||||||||
| 3697 | |||||||||
| Description | Phenotype | WBPhenotype:0000583 | Paper_evidence | WBPaper00000031 | |||||
| WBPaper00032031 | |||||||||
| Person_evidence | WBPerson261 | ||||||||
| Curator_confirmed | WBPerson48 | ||||||||
| WBPerson712 | |||||||||
| Remark | Animals are morphologically similar to dpy-9. | Paper_evidence | WBPaper00032031 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Strong dumpy; e184/+ is medium dumpy. | Person_evidence | WBPerson261 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Semi_dominant | Paper_evidence | WBPaper00000031 | |||||||
| Person_evidence | WBPerson261 | ||||||||
| Curator_confirmed | WBPerson48 | ||||||||
| WBPerson712 | |||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | Pnlp-29::GFP | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Ease_of_scoring | ES3_Easy_to_score | Person_evidence | WBPerson261 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_not_observed | WBPhenotype:0000505 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Males are not Ram. | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| EQ_annotations | Anatomy_term | WBbt:0006941 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Life_stage | WBls:0000056 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Temperature | 20C | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Genotype | him-5(e1490) | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0000717 | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Animals exhibited levels of pnlp-29::GFP similar to wild-type controls under normal culture conditions. | Paper_evidence | WBPaper00032031 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | Pnlp-29::GFP | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0000876 | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Animals are no more resistant to high salt than wild-type worms. | Paper_evidence | WBPaper00032031 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | Pnlp-29::GFP | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0000901 | Paper_evidence | WBPaper00040002 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | mutation has no effect on gland morphology | Paper_evidence | WBPaper00040002 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0001426 | Paper_evidence | WBPaper00004883 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | arIs37 | Paper_evidence | WBPaper00004883 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Reference (21) | |||||||||
| Remark | Created by WBPerson51134 from the NN_VFP_triage_pipeline | ||||||||
| Variation stub/paper connection generated from the May 2021 NN VFP dataset. | |||||||||
| Method | Allele |
