WormBase Tree Display for Variation: WBVar00143017
expand all nodes | collapse all nodes | view schema
| WBVar00143017 | Name | Public_name | e184 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Other_name | e184sd | ||||||||
| Sequence_details | SeqStatus | Pending_curation | |||||||
| Variation_type | Allele | ||||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis elegans | |||||||
| Strain (68) | |||||||||
| Laboratory | CB | ||||||||
| Status | Live | ||||||||
| Affects | Gene | WBGene00001074 | |||||||
| Interactor | WBInteraction000052056 | ||||||||
| WBInteraction000052059 | |||||||||
| WBInteraction000517612 | |||||||||
| WBInteraction000517732 | |||||||||
| WBInteraction000517733 | |||||||||
| Genetics | Mapping_data | In_2_point (66) | |||||||
| In_multi_point | 52 | ||||||||
| 96 | |||||||||
| 98 | |||||||||
| 99 | |||||||||
| 100 | |||||||||
| 101 | |||||||||
| 102 | |||||||||
| 103 | |||||||||
| 105 | |||||||||
| 106 | |||||||||
| 107 | |||||||||
| 108 | |||||||||
| 109 | |||||||||
| 110 | |||||||||
| 111 | |||||||||
| 112 | |||||||||
| 114 | |||||||||
| 115 | |||||||||
| 116 | |||||||||
| 121 | |||||||||
| 122 | |||||||||
| 123 | |||||||||
| 124 | |||||||||
| 126 | |||||||||
| 127 | |||||||||
| 128 | |||||||||
| 159 | |||||||||
| 222 | |||||||||
| 224 | |||||||||
| 286 | |||||||||
| 287 | |||||||||
| 302 | |||||||||
| 332 | |||||||||
| 334 | |||||||||
| 339 | |||||||||
| 340 | |||||||||
| 341 | |||||||||
| 351 | |||||||||
| 418 | |||||||||
| 455 | |||||||||
| 456 | |||||||||
| 457 | |||||||||
| 458 | |||||||||
| 459 | |||||||||
| 460 | |||||||||
| 465 | |||||||||
| 484 | |||||||||
| 490 | |||||||||
| 495 | |||||||||
| 508 | |||||||||
| 509 | |||||||||
| 539 | |||||||||
| 541 | |||||||||
| 568 | |||||||||
| 569 | |||||||||
| 570 | |||||||||
| 578 | |||||||||
| 596 | |||||||||
| 625 | |||||||||
| 659 | |||||||||
| 660 | |||||||||
| 676 | |||||||||
| 680 | |||||||||
| 681 | |||||||||
| 682 | |||||||||
| 727 | |||||||||
| 776 | |||||||||
| 798 | |||||||||
| 810 | |||||||||
| 811 | |||||||||
| 812 | |||||||||
| 897 | |||||||||
| 898 | |||||||||
| 901 | |||||||||
| 903 | |||||||||
| 904 | |||||||||
| 905 | |||||||||
| 906 | |||||||||
| 907 | |||||||||
| 908 | |||||||||
| 917 | |||||||||
| 918 | |||||||||
| 919 | |||||||||
| 920 | |||||||||
| 921 | |||||||||
| 922 | |||||||||
| 924 | |||||||||
| 962 | |||||||||
| 1115 | |||||||||
| 1125 | |||||||||
| 1126 | |||||||||
| 1127 | |||||||||
| 1132 | |||||||||
| 1258 | |||||||||
| 1259 | |||||||||
| 1292 | |||||||||
| 1366 | |||||||||
| 1422 | |||||||||
| 1512 | |||||||||
| 1561 | |||||||||
| 1642 | |||||||||
| 1744 | |||||||||
| 1746 | |||||||||
| 1926 | |||||||||
| 1927 | |||||||||
| 2009 | |||||||||
| 2237 | |||||||||
| 2827 | |||||||||
| 2828 | |||||||||
| 3058 | |||||||||
| 3059 | |||||||||
| 3150 | |||||||||
| 3249 | |||||||||
| 3252 | |||||||||
| 3289 | |||||||||
| 3290 | |||||||||
| 5460 | |||||||||
| In_pos_neg_data | 2162 | ||||||||
| 3697 | |||||||||
| Description | Phenotype | WBPhenotype:0000583 | Paper_evidence | WBPaper00000031 | |||||
| WBPaper00032031 | |||||||||
| Person_evidence | WBPerson261 | ||||||||
| Curator_confirmed | WBPerson48 | ||||||||
| WBPerson712 | |||||||||
| Remark | Animals are morphologically similar to dpy-9. | Paper_evidence | WBPaper00032031 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Strong dumpy; e184/+ is medium dumpy. | Person_evidence | WBPerson261 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Semi_dominant | Paper_evidence | WBPaper00000031 | |||||||
| Person_evidence | WBPerson261 | ||||||||
| Curator_confirmed | WBPerson48 | ||||||||
| WBPerson712 | |||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | Pnlp-29::GFP | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Ease_of_scoring | ES3_Easy_to_score | Person_evidence | WBPerson261 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_not_observed | WBPhenotype:0000505 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Males are not Ram. | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| EQ_annotations | Anatomy_term | WBbt:0006941 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Life_stage | WBls:0000056 | PATO:0000460 | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Temperature | 20C | Paper_evidence | WBPaper00001328 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Genotype | him-5(e1490) | Paper_evidence | WBPaper00001328 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0000717 | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Animals exhibited levels of pnlp-29::GFP similar to wild-type controls under normal culture conditions. | Paper_evidence | WBPaper00032031 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | Pnlp-29::GFP | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0000876 | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | Animals are no more resistant to high salt than wild-type worms. | Paper_evidence | WBPaper00032031 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | Pnlp-29::GFP | Paper_evidence | WBPaper00032031 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0000901 | Paper_evidence | WBPaper00040002 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Remark | mutation has no effect on gland morphology | Paper_evidence | WBPaper00040002 | ||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| WBPhenotype:0001426 | Paper_evidence | WBPaper00004883 | |||||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Phenotype_assay | Genotype | arIs37 | Paper_evidence | WBPaper00004883 | |||||
| Curator_confirmed | WBPerson712 | ||||||||
| Reference (21) | |||||||||
| Remark | Created by WBPerson51134 from the NN_VFP_triage_pipeline | ||||||||
| Variation stub/paper connection generated from the May 2021 NN VFP dataset. | |||||||||
| Method | Allele |
